UniversitÓ degli Studi di Pavia - FacoltÓ di Scienze MMFFNN

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Bioinformatics

Corsi di laurea:
Molecular Biology and Genetic
Docenti:
Lisa A., Astolfi Paola
Anno accademico:
2010/2011
Crediti formativi:
6
Decreto Ministeriale:
270/04
Ore di lezione:
48
Lingua di insegnamento:
Inglese

ModalitÓ

Un' unica prova scritta di due ore in aula informatizzata e successiva discussione orale verteranno sugli argomenti dei due moduli del corso.

Prerequisiti

Conoscenza dei fondamenti di Genetica e Biologia Molecolare

Programma

Parte I -Natura e scopo della bioinformatica. Siti internazionali NCBI e EBI ed integrazione delle relative banche dati. Caratteristiche ed utilizzo delle principali banche dati bibliografiche e molecolari.
Caratteristiche delle banche dati molecolari primarie e secondarie e loro differenze. Risorse genomiche e progetti genoma.

Parte II- Utilizzo del software MapViewer? per la localizzazione di marcatori. Il concetto di similaritÓ di sequenze e utilizzo di software per la ricerca e la valutazione dell'allineamento semplice e multiplo di sequenze. Concetti di base di evoluzione molecolare e analisi filogenetica.

Bibliografia

Arthur M. Lesk - Bioinformatics - Oxford University Press
Westhead DR, Parish JH, Twyman RM. Bioinformatics (Instant notes), Taylor and Francis, ed.


Moduli

Modulo:
mod. 1
Docente:
Lisa A.
Ore di lezione:
24
Crediti formativi:
3

Programma

Natura e scopo della bioinformatica. Siti internazionali NCBI e EBI ed integrazione delle relative banche dati. Caratteristiche ed utilizzo delle principali banche dati bibliografiche e molecolari.
Differenze e caratteristiche delle banche dati molecolari primarie e secondarie. Risorse genomiche e progetti genoma.

Bibliografia

Arthur M. Lesk - Bioinformatics - Oxford University Press
Westhead DR, Parish JH, Twyman RM. Bioinformatics (Instant notes), Taylor and Francis, ed.


Modulo:
mod. 2
Docente:
Astolfi Paola
Ore di lezione:
24
Crediti formativi:
3

Programma

Utilizzo del software MapViewer? per la localizzazione di marcatori. Il concetto di similaritÓ di sequenze e utilizzo di software per la ricerca e la valutazione dell'allineamento semplice e multiplo. Concetti di base di evoluzione molecolare e analisi filogenetica.

Bibliografia

Arthur M. Lesk - Bioinformatics - Oxford University Press
Westhead DR, Parish JH, Twyman RM. Bioinformatics (Instant notes), Taylor and Francis, ed.


Elenco appelli e prove

Nessuna prova presente

Credits: apnetwork.it