UniversitÓ degli Studi di Pavia - FacoltÓ di Scienze MMFFNN

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Genetica dei Microrganismi e Genomica Funzionale

Corsi di laurea:
Biotecnologie industriali
Docenti:
Galizzi Alessandro, Calvio Cinzia
Anno accademico:
2009/2010
Crediti formativi:
6
Ambito:
BIO/18
Decreto Ministeriale:
509/99
Lingua di insegnamento:
Italiano

ModalitÓ

Esame orale

Prerequisiti

Nessuno

Programma

Genomica Strutturale
Sequenziamento del DNA ed evoluzione del metodo di Sanger fino ai sequenziatori multicapillare
Nuove tecnologie di sequenziamento: Pyrosequencing, Illumina, SOLiD?
Genomica comparativa; Resequencing e Metagenomica
Struttura dei genomi batterici e il Pangenoma
Genomica Funzionale
Trascrittomica: Northern Blotting, DD, SAGE, qRT-PCR, Microarray
Altre applicazioni degli array in Trascrittomica e Genomica: Tiling array, Resequencing, CGH, ChIP?-on-chip
Proteomica: Spettrometria di massa, Peptide Mass Fingerprint, Tandem MS
Proteomica quantitativa e delle modificazioni post-traduzionali: DiGE?, SIL, ICAT, MuDPIT?, SELDI
Interattomica: Y2H?, B2H?, Affinity Purification-MS (TAP)
Produzione di proteine H-T e loro utilizzo
Metabolomica
Systems Biology

Genetica dei Microorganismi
La mutazione spontanea nei batteri: test di fluttuazione, esperimento di Newcombe, replica plating, sib-selection
Plasmidi: Sistemi di replicazione e di mantenimento: controllo del Copy number e della segregazione e gruppi di incompatibilitÓ
Coniugazione: Il plasmide F e il meccanismo di trasferimento, Hfr, F’. I geni vir di Agrobacterium, plasmidi coniugativi nei Gram +. Scoperta della coniugazione e mappaggio genico
Competenza genetica e trasformazione: la regolazione della competenza in Bacillus subtilis.
Batteriofagi: Sistemi di regolazione dell’espressione genica e di replicazione dei fagi litici. Il ciclo litico e temperato del fago lambda. Trasduzione fagica.

Bibliografia

L. Snyder & W. Champness – Molecular Genetics of Bacteria, 3rd Edition. ASM Press.


Moduli

Docente:
Galizzi Alessandro

Programma

Genetica dei Microorganismi
La mutazione spontanea nei batteri: test di fluttuazione, esperimento di Newcombe, replica plating, sib-selection
Plasmidi: Sistemi di replicazione e di mantenimento: controllo del Copy number e della segregazione e gruppi di incompatibilitÓ
Coniugazione: Il plasmide F e il meccanismo di trasferimento, Hfr, F’. I geni vir di Agrobacterium, plasmidi coniugativi nei Gram +. Scoperta della coniugazione e mappaggio genico
Competenza genetica e trasformazione: la regolazione della competenza in Bacillus subtilis.
Batteriofagi: Sistemi di regolazione dell’espressione genica e di replicazione dei fagi litici. Il ciclo litico e temperato del fago lambda. Trasduzione fagica.

Bibliografia

L. Snyder & W. Champness – Molecular Genetics of Bacteria, 3rd Edition. ASM Press.


Modulo:
Genetica dei Microorganismi e Genomica Funzionale
Docente:
Calvio Cinzia

Programma

Genomica Strutturale
Sequenziamento del DNA ed evoluzione del metodo di Sanger fino ai sequenziatori multicapillare
Nuove tecnologie di sequenziamento: Pyrosequencing, Illumina, SOLiD?-
Genomica comparativa; Resequencing e Metagenomica
Struttura dei genomi batterici e il Pangenoma
Genomica Funzionale
Trascrittomica: Northern Blotting, DD, SAGE, qRT-PCR, Microarray
Altre applicazioni degli array in Trascrittomica e Genomica: Tiling array, Resequencing, CGH, ChIP?-on-chip
Proteomica: Spettrometria di massa, Peptide Mass Fingerprint, Tandem MS
Proteomica quantitativa e delle modificazioni post-traduzionali: DiGE?, SIL, ICAT, MuDPIT?, SELDI
Interattomica: Y2H?, B2H?, Affinity Purification-MS (TAP)
Produzione di proteine H-T e loro utilizzo
Metabolomica
Systems Biology


Elenco appelli e prove

Nessuna prova presente

Credits: apnetwork.it